Qalqilya est une ville palestinienne agricole de Cisjordanie, avancée comme un promontoire dans la plaine de Tel-Aviv, et qui compte environ 45.000 habitants.
Sur tout son périmètre de 11km, la ville est totalement entourée depuis 2003 par un mur de béton de 8 m. de hauteur surmonté de 4 miradors, sur 2km de longueur, ou par une barrière de séparation de 60 m. de large, sur 8km de longueur, ou par des rouleaux de barbelés sur 1km de longueur. Une seule route, contrôlée par un check-point tenu par une demi-douzaine de gardes-frontières de l’armée d'occupation israélienne, constitue le seul point d’accès.

Qalqilya est très proche de la mer (12 km à vol d’oiseau, mais qui reste inaccessible), et se situe le long d’une partie de la ligne verte (qui constitue la ligne de cessez-le feu entre Israël et la Cisjordanie depuis 1949), et non loin de l'axe routier israélien n°6 qui relie Nazareth au Nord à Beersheba au Sud.

Elle est établie sur un emplacement occupé par l'homme depuis la préhistoire. La ville est attestée à l'époque romaine sous le nom de Kalkaliya.

En 1948, après la défaite arabe, la ville vit affluer des milliers de réfugiés palestiniens qui s'installèrent dans un quartier de la ville (ils sont appelés « ceux de Kufre Saba et d'Arab Abu Kishek »). Qalqilya ne vit jamais la création d'un camp de réfugiés car ceux-ci furent intégrés dans la ville en échange d'un soutien de l'UNRWA. Lorsque l'État d'Israël fut créé, la municipalité de Qalqilya se vit amputée de 80% de ses terres agricoles, qui se sont retrouvées de l'autre côté de la ligne d'armistice de 1949. Entre 1949 et 1967, la ville, comme le reste de la Cisjordanie, passa sous souveraineté jordanienne. Les agriculteurs de la ville essayaient régulièrement de passer de l'autre côté de la frontière pour travailler leurs terres annexées. Pour punir ces infiltrations, l'armée israélienne attaqua Qalqilya à plusieurs reprises et détruisit de nombreux puits artésiens.

Il existe des versions différentes sur la très importante destruction que subit la ville en 1967.
Suivant l’article de Terence Smith, dans le “New York Times” du 23 juin 1967, page 13, « des responsables de l’armée israélienne ont reconnu [ce 22 juin] que 40% des constructions de la ville ont été détruites, mais en insistant sur le fait que les dommages ont été provoqués par des bombardements durant la guerre [du 6 au 10 juin 1967] ».
Suivant l’historien israélien Ilan Pappé, dans son ouvrage « History of Modern Palestine : One Land, Two Peoples » (Cambridge University Press, 2003), la destruction totale de la ville aurait été ordonnée en juillet 1967 par Moshe Dayan, alors Ministre de la défense, en guise de punition pour la résistance armée de ses habitants. 50% des habitations ont été démolies au cours de cette opération.

Suite à des pressions diplomatiques, la destruction totale de la ville n’a pas eu lieu.

Depuis la guerre de 1967, la ville est occupée par Israël, comme le reste de la Cisjordanie, et après les accords d'Oslo, la ville est passée sous la juridiction de l'Autorité palestinienne (« zone A »).
En dépit de ces accords, et surtout depuis le déclenchement de la seconde Intifada en 2000, les forces armées israéliennes entrent régulièrement à Qalqilya, souvent pour le motif de procéder à des arrestations.